Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRMD4BQ9Y2L6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMD4BQ9Y2L6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRMD4BQ9Y2L6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMD4BQ9Y2L6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMD4BQ9Y2L6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRMD4BQ9Y2L6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMD4BQ9Y2L6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMD4BQ9Y2L6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMD4BQ9Y2L6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMD4BQ9Y2L6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRMD4BQ9Y2L6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FRMD4BQ9Y2L6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRMD4BQ9Y2L6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD4BQ9Y2L6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD4BQ9Y2L6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD4BQ9Y2L6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRMD4BQ9Y2L6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMD4BQ9Y2L6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMD4BQ9Y2L6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMD4BQ9Y2L6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMD4BQ9Y2L6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMD4BQ9Y2L6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMD4BQ9Y2L6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMD4BQ9Y2L6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRMD4BQ9Y2L6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms