Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFSF13BQ9Y275 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNFSF13BQ9Y275 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF13BQ9Y275 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFSF13BQ9Y275 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms