Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3LQ9Y262 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3LQ9Y262 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3LQ9Y262 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3LQ9Y262 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3LQ9Y262 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3LQ9Y262 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3LQ9Y262 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3LQ9Y262 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3LQ9Y262 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EIF3LQ9Y262 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 375.1 ms