Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPT1Q9Y234 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LIPT1Q9Y234 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LIPT1Q9Y234 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms