Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCML2Q9UQR0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SCML2Q9UQR0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCML2Q9UQR0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCML2Q9UQR0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCML2Q9UQR0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCML2Q9UQR0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCML2Q9UQR0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms