Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTF2Q9UNY4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTF2Q9UNY4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTF2Q9UNY4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TTF2Q9UNY4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms