Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE2

RPH3AL, Rab effector Noc2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3ALQ9UNE2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPH3ALQ9UNE2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPH3ALQ9UNE2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPH3ALQ9UNE2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPH3ALQ9UNE2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RPH3ALQ9UNE2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms