Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHTF1Q9UMS5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHTF1Q9UMS5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHTF1Q9UMS5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms