Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CAPN11Q9UMQ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN11Q9UMQ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN11Q9UMQ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAPN11Q9UMQ6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms