Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
ALKQ9UM73 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ALKQ9UM73 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ALKQ9UM73 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms