Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIMKLBQ9ULI2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIMKLBQ9ULI2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms