Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXL3Q9UKT7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXL3Q9UKT7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXL3Q9UKT7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms