Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRDM4Q9UKN5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRDM4Q9UKN5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM4Q9UKN5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM4Q9UKN5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms