Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASP8AP2Q9UKL3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASP8AP2Q9UKL3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CASP8AP2Q9UKL3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CASP8AP2Q9UKL3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms