Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED13Q9UHV7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED13Q9UHV7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms