Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMC3IPQ9P2W1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMC3IPQ9P2W1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMC3IPQ9P2W1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms