Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMG20BQ9P0W2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
HMG20BQ9P0W2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HMG20BQ9P0W2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms