Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMP5Q9NZZ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CHMP5Q9NZZ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHMP5Q9NZZ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMP5Q9NZZ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms