Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM53CQ9NYF3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM53CQ9NYF3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53CQ9NYF3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM53CQ9NYF3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms