Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VNN3Q9NY84 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VNN3Q9NY84 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VNN3Q9NY84 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms