Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CWC25Q9NXE8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CWC25Q9NXE8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CWC25Q9NXE8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CWC25Q9NXE8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CWC25Q9NXE8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CWC25Q9NXE8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CWC25Q9NXE8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CWC25Q9NXE8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CWC25Q9NXE8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms