Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH5Q9NX47 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH5Q9NX47 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH5Q9NX47 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MARCH5Q9NX47 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH5Q9NX47 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH5Q9NX47 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH5Q9NX47 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH5Q9NX47 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH5Q9NX47 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH5Q9NX47 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MARCH5Q9NX47 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MARCH5Q9NX47 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MARCH5Q9NX47 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms