Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX24

NHP2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2Q9NX24 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NHP2Q9NX24 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms