Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU7

SDAD1, Protein SDA1 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDAD1Q9NVU7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 27.6
SDAD1Q9NVU7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.283e-7■■■■■ 27.5
SDAD1Q9NVU7 DYRK1A-207ENST00000462274 1189 ntTSL 1 (best)23.51■■□□□ 1.353e-10■■■■■ 27.5
SDAD1Q9NVU7 DYRK1A-209ENST00000608928 483 ntTSL 519.93■□□□□ 0.783e-10■■■■■ 27.5
SDAD1Q9NVU7 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC11.06□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 27.5
SDAD1Q9NVU7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.421e-7■■■■■ 27.4
SDAD1Q9NVU7 ZNF598-207ENST00000565396 4457 ntTSL 221.28■■□□□ 11e-7■■■■■ 27.4
SDAD1Q9NVU7 ZNF598-203ENST00000562988 3382 ntTSL 520.26■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 27.4
SDAD1Q9NVU7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 27.4
SDAD1Q9NVU7 HDAC6-220ENST00000477528 4832 ntTSL 1 (best)15.7■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 27.3
SDAD1Q9NVU7 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 27.3
SDAD1Q9NVU7 HDAC6-203ENST00000376619 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 27.3
SDAD1Q9NVU7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 27.3
SDAD1Q9NVU7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.445e-6■■■■■ 27.2
SDAD1Q9NVU7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.285e-6■■■■■ 27.2
SDAD1Q9NVU7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.235e-6■■■■■ 27.2
SDAD1Q9NVU7 GANAB-207ENST00000526732 824 ntTSL 211.68□□□□□ -0.544e-29■■■■■ 27.2
SDAD1Q9NVU7 TMEM94-229ENST00000583795 557 ntTSL 49.79□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 27.2
SDAD1Q9NVU7 TNS1-212ENST00000453356 601 ntTSL 36.33□□□□□ -1.41e-7■■■■■ 27.2
SDAD1Q9NVU7 TMC6-211ENST00000589271 1099 ntTSL 516.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 27.1
SDAD1Q9NVU7 PGGHG-208ENST00000529087 745 ntTSL 216.77■□□□□ 0.285e-17■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.084e-9■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 NCOR2-211ENST00000443451 951 ntTSL 513.62□□□□□ -0.234e-9■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 NCOR2-206ENST00000418829 563 ntTSL 313.58□□□□□ -0.244e-9■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 NCOR2-205ENST00000413172 532 ntTSL 312.72□□□□□ -0.374e-9■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 SGSM2-207ENST00000573062 1335 ntTSL 226.26■■□□□ 1.794e-7■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.674e-7■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 SGSM2-211ENST00000574563 3410 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 CABIN1-201ENST00000263119 7222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 27
SDAD1Q9NVU7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 26.9
SDAD1Q9NVU7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 26.9
SDAD1Q9NVU7 DGAT1-203ENST00000524965 1336 ntTSL 512.09□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 26.9
SDAD1Q9NVU7 DGAT1-202ENST00000524844 401 ntTSL 37.31□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 26.9
SDAD1Q9NVU7 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.459e-7■■■■■ 26.9
SDAD1Q9NVU7 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.459e-7■■■■■ 26.9
SDAD1Q9NVU7 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 26.9
SDAD1Q9NVU7 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.59e-7■■■■■ 26.9
SDAD1Q9NVU7 VARS2-209ENST00000477288 6054 ntTSL 220.77■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 26.8
SDAD1Q9NVU7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 26.8
SDAD1Q9NVU7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 26.8
SDAD1Q9NVU7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 26.8
SDAD1Q9NVU7 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 26.8
SDAD1Q9NVU7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.833e-6■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.013e-6■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.761e-7■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.895e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 STK11IP-209ENST00000473899 615 ntTSL 220.35■□□□□ 0.855e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.815e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-216ENST00000581202 1013 ntTSL 518.36■□□□□ 0.535e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.485e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 PPP6R1-204ENST00000587457 2389 ntTSL 217■□□□□ 0.315e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.25e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.145e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 315.66■□□□□ 0.15e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-203ENST00000374611 1722 ntTSL 515.53■□□□□ 0.085e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.045e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-218ENST00000581795 1430 ntTSL 215.22■□□□□ 0.035e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-208ENST00000577432 866 ntTSL 515.01□□□□□ -0.015e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 STK11IP-210ENST00000475396 2251 ntTSL 214.16□□□□□ -0.145e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.275e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-220ENST00000582907 1454 ntTSL 513.1□□□□□ -0.315e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-209ENST00000577812 2598 ntTSL 512.74□□□□□ -0.375e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 312.59□□□□□ -0.395e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.45e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-225ENST00000584445 2484 ntTSL 212.29□□□□□ -0.445e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 PC-202ENST00000393958 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.715e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 PC-203ENST00000393960 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.725e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 PC-201ENST00000393955 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.795e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-227ENST00000584965 300 ntTSL 39.86□□□□□ -0.835e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 NARF-226ENST00000584513 500 ntTSL 38.56□□□□□ -1.045e-8■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 26.6
SDAD1Q9NVU7 HNRNPL-203ENST00000595164 2404 ntTSL 213.88□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 26.5
SDAD1Q9NVU7 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 26.5
SDAD1Q9NVU7 HNRNPL-206ENST00000597731 3094 ntTSL 210.71□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 26.5
SDAD1Q9NVU7 AC008982.1-202ENST00000602021 342 ntTSL 57.35□□□□□ -1.232e-6■■■■□ 26.5
SDAD1Q9NVU7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.073e-6■■■■□ 26.5
SDAD1Q9NVU7 FAM193B-208ENST00000506955 4604 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.363e-6■■■■□ 26.5
SDAD1Q9NVU7 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 26.5
SDAD1Q9NVU7 FAM193B-214ENST00000510479 2800 ntTSL 212.76□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 26.5
SDAD1Q9NVU7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.131e-7■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.771e-7■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 DENND4A-206ENST00000564674 3389 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.71e-7■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 AC079781.5-201ENST00000641390 3211 nt19.15■□□□□ 0.661e-7■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 AJUBA-205ENST00000553736 751 ntTSL 218.56■□□□□ 0.562e-14■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 AC079781.5-203ENST00000641315 2059 nt18.54■□□□□ 0.561e-7■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.561e-7■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.511e-7■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-7■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.491e-7■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 PAWR-208ENST00000550006 493 ntTSL 318.04■□□□□ 0.484e-8■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.441e-7■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.361e-7■■■■□ 26.4
SDAD1Q9NVU7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-7■■■■□ 26.4
Retrieved 100 of 11,671 protein–RNA pairs in 63.8 ms