Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL11Q9NVR0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL11Q9NVR0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL11Q9NVR0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms