Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCP11L1Q9NUJ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCP11L1Q9NUJ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCP11L1Q9NUJ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms