Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC3Q9NUD5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZCCHC3Q9NUD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZCCHC3Q9NUD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms