Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOMER3Q9NSC5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOMER3Q9NSC5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOMER3Q9NSC5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms