Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDHAF3Q9NRP4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SDHAF3Q9NRP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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