Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF4Q9NR80 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF4Q9NR80 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF4Q9NR80 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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