Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF3Q9NR23 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF3Q9NR23 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GDF3Q9NR23 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms