Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL40Q9NQ50 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL40Q9NQ50 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL40Q9NQ50 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms