Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCUBE2Q9NQ36 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCUBE2Q9NQ36 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCUBE2Q9NQ36 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCUBE2Q9NQ36 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms