Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NLRC4Q9NPP4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLRC4Q9NPP4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLRC4Q9NPP4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms