Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED4Q9NPJ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED4Q9NPJ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED4Q9NPJ6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MED4Q9NPJ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms