Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRD7Q9NPI1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRD7Q9NPI1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD7Q9NPI1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms