Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUFT1Q9NNX1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TUFT1Q9NNX1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TUFT1Q9NNX1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUFT1Q9NNX1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms