Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLXNA4Q9HCM2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXNA4Q9HCM2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLXNA4Q9HCM2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms