Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK4Q9HAZ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLK4Q9HAZ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLK4Q9HAZ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLK4Q9HAZ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms