Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR41Q9HAD4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR41Q9HAD4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms