Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6W3

RIOX1, Ribosomal oxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX1Q9H6W3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RIOX1Q9H6W3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RIOX1Q9H6W3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms