Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RWDD1Q9H446 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RWDD1Q9H446 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RWDD1Q9H446 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RWDD1Q9H446 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms