Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA4AQ9H3S1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4AQ9H3S1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms