Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM60Q9H2L4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM60Q9H2L4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM60Q9H2L4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms