Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTBN4Q9H254 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN4Q9H254 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms