Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXD1Q9GZZ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD1Q9GZZ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms