Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B3GNT4Q9C0J1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
B3GNT4Q9C0J1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B3GNT4Q9C0J1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms