Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BRINP2Q9C0B6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRINP2Q9C0B6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRINP2Q9C0B6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRINP2Q9C0B6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRINP2Q9C0B6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRINP2Q9C0B6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRINP2Q9C0B6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP2Q9C0B6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRINP2Q9C0B6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRINP2Q9C0B6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRINP2Q9C0B6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms