Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXP3Q9BZS1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXP3Q9BZS1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXP3Q9BZS1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms