Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SETD2Q9BYW2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SETD2Q9BYW2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SETD2Q9BYW2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SETD2Q9BYW2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SETD2Q9BYW2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SETD2Q9BYW2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SETD2Q9BYW2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SETD2Q9BYW2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SETD2Q9BYW2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SETD2Q9BYW2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms